幽灵系宝可梦的捕捉流程与其他属性存在显著差异。游戏初期在紫苑镇口袋妖怪塔遇到的幽灵实际上是无法直接捕捉的幻影，必须先在彩虹市游戏厅击败火箭队并获取关键道具希鲁夫观测镜后才能显现其真实形态。这一设定增加了幽灵系宝可梦的神秘感和获取难度，需要玩家完成特定剧情线才能解锁捕捉权限。
捕捉幽灵系宝可梦的核心目标是鬼斯家族，包括鬼斯、鬼斯通和最终进化形态耿鬼。鬼斯通在口袋妖怪塔3层及以上出现概率为1%-15%，楼层提升遭遇率逐步增加。鬼斯通需要通过通讯交换才能进化为耿鬼，这是游戏内少数需要联机功能才能完成的进化链。野生鬼斯虽然更容易捕捉，但需要提升至25级进化为鬼斯通，两种获取途径各有利弊。
战斗准备方面，幽灵属性免疫普通系攻击的特性要求玩家必须配备特殊技能。建议使用超能力系或恶系技能进行压制，同时携带能够施加异常状态的宝可梦，如使用催眠粉的草系或具备黑色眼神的特定宝可梦。道具准备上，高级球、超级球的数量不应少于20个，同时建议携带解除诅咒状态的万灵药。
捕捉过程中的战术执行需要精确控制。先将目标血量削弱至红色区域但不可过度攻击，最佳状态是剩余1/3血量时使用催眠或麻痹状态。鬼斯通具有较高逃脱率，建议在其处于异常状态时立即使用高级球连续投掷。若捕捉失败，需及时补充状态效果再尝试，这个过程可能需要重复多次。
完成捕捉后，通讯进化是获得耿鬼的必要步骤。在没有联机条件的情况下，鬼斯通仍可发挥战斗价值，其高特攻和丰富的技能组合在游戏中期颇具优势。紫苑镇塔顶的野生耿鬼属于特殊剧情设定，无法通过常规方式捕获，这个设定保持了传说宝可梦的独特性。
