少年三国志零采用了偏写实的风格，武将和场景都更接近真实比例，而少年三国志1则是经典的Q版卡通风格。这种画风差异直接影响了整体视觉体验，零代看起来更成熟稳重，一代则更轻松活泼。在武将建模方面，零代的细节更丰富，特别是战斗时的动作表现更细腻。不过零代因为建模更复杂，对手机配置要求会稍微高一些。
零代引入了创新的4×4布阵系统，可以自由调整16个格子的站位，搭配六大兵种和军师技能，策略性明显增强。而一代是传统卡牌对战模式，主要靠武将培养和技能搭配。零代还加入了士兵系统，每个武将都带着小兵出战，战场规模更大更热闹。一代则是纯粹的武将对决，节奏更快更直接。零代需要更多考虑兵种克制和站位调整，一代更注重武将养成和技能组合。
零代加入了军师培养和士兵强化两条新线，整体养成维度更多元。一代专注于武将收集和突破，系统相对简单直接。零代的装备系统更复杂，有套装效果和强化路线选择，一代的装备主要是数值提升。在资源分配上，零代需要考虑军师、士兵、武将三方面的投入，一代只要专注武将培养就行。这种差异让零代玩起来更有深度，但也更耗费精力。
零代强化了联盟玩法，增加了跨服争夺和团队副本，社交性更强。一代的竞技场和公会战更偏向个人实力展示。零代的PVP需要考虑更多阵容克制和实时策略调整，一代则更看重武将练度和阵容搭配。零代还加入了赛季制玩法，定期更新内容和奖励，保持新鲜感。一代的PVP玩法相对固定，主要是排名竞争和资源争夺。
零代更适合喜欢深度策略和团队协作的玩家，游戏节奏相对慢热，需要投入时间研究各种系统。一代则更适合休闲玩家，上手简单，每天不需要花太多时间就能跟上进度。零代的剧情采用了多视角叙事，代入感更强；一代的剧情更线性直接。两款游戏各有特色，选择哪款主要看个人喜好，喜欢烧脑策略就选零代，偏好轻松养成就选一代。
